Το ανώτατο διοικητικό μας όργανο είναι η ετήσια Γενική Συνέλευση (ΓΣ), στην οποία συμμετέχουν εκπρόσωποι όλων των οργανώσεων – μελών της ΕΠΠ. Η ΓΣ αποφασίζει τη στρατηγική μας και εγκρίνει τους ετήσιους λογαριασμούς, το πρόγραμμα και τον προϋπολογισμό μας για το επόμενο έτος. Η ΓΣ λειτουργεί εν γένει λαμβάνοντας αποφάσεις για τα σημαντικότερα ζητήματα που καλείται να αντιμετωπίσει ο οργανισμός. Κάθε δύο χρόνια, η ΓΣ εκλέγει τον/την Πρόεδρο, τον/την Αντιπρόεδρο και τον/την διαχειριστή/ρια της ΕΠΠ. Ο τελευταίος εκπροσωπεί την οργάνωση και διευθύνει τις δραστηριότητές της.
Μεταξύ των συνεδριάσεων της ΓΣ, μια Εκτελεστική Επιτροπή, αποτελούμενη από 5 μέλη που εκλέγονται επίσης από τη ΓΣ, είναι υπεύθυνη για τη λήψη αποφάσεων που αφορούν σημαντικά θέματα και υποστηρίζει τον/τη διαχειριστή/στρια στο έργο.
